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晶能生物開啟全新定制Twist人核心外顯子組捕獲測序服務
發布日期:2019-11-11瀏覽:
如果你正在使用“某種疾病的大panel檢測突變位點”;
 
如果你關注“外顯子區域的CNV”;
如果你的樣本“起始模板量低”;
 
Twist人核心外顯子組捕獲試劑盒適合你。
 
因為,Twist人核心外顯子組捕獲試劑盒,
 
是常備試劑,備貨靈活
它檢測性能優越,具有卓越的捕獲覆蓋均一度
配備高保真雙鏈DNA探針,大大提高模板利用率
高性價比
...
 
為什么推薦使用“Twist人核心外顯子捕獲試劑盒”?

? 高效的CCDS/refgene CDS區域覆蓋
 
 
? 高度均一性
1. twist的The fold 80 base penalty為1.43,競品為2.0。Fold80 越大,均一性越差,一般2以內均一性較好。(標準品測試結果)
 
注:Fold80表示平均深度/(80%以上區域被覆蓋的深度)。
 
2. 覆蓋圖顯示,與競爭對手相比,Twist 所生成的數據具有更高均一性,降低測序成本。(標準品測試結果)
 
注:左圖:覆蓋度小于 30x 的區域數量比競品低,在6G有效數據量時,覆蓋度大于 30x的區域便可達到95%。
右圖:15G數據量時,TwistCR的峰值深度比競品大,數據利用率高。
 
 
晶能生物全新推出“人核心外顯子組完整解決方案”

在科研及臨床中,基因組分析的核心是致病突變的鑒定,從而確定在正常生物學和疾病狀態中發揮作用的分子通路。靶向測序(特別是全外顯子測序),能有效的將測序成本集中在目標基因組范圍內,是臨床或基礎研究中檢測致病突變的有力方法。
 
但在實驗過程中,特別的針對一些高度重復、GC含量高以及非唯一的基因組區域,常有區域特異性偏好和不均一性,這都極大的影響著整體數據質量和分析效率。
 
晶能生物全新推出「人核心外顯子組測序服務」,采用全新定制的Twist Bioscience NGS靶向富集試劑盒,高效覆蓋人CCDS的高度保守蛋白編碼區域,提供高度均一且優化良好的捕獲方案,適用于多種應用。
 
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? 兩個版本
 
? 樣本要求
 
? 分析方向和內容
 
Twist靶向捕獲應用實例

 
本研究構建了正常組織類器官和腎細胞癌組織培養的類器官模型,并將其與原代組織的多種反應進行表征和比較。研究發表于2019年2月《Cell Death and Disease》雜志。
 
研究外顯子測序部分,作者使用Twist Bioscience人核心外顯子組試劑盒對3個腎細胞癌患者的正常組織類器官、腫瘤類器官、親代正常組織和親代腫瘤組織的外顯子進行富集測序,并對檢測到的突變進行比較。
 
結果顯示,腫瘤類器官與親代腫瘤組織之間有95%的相關性,且腫瘤類器官為具有不同基因組的異質性細胞混合物;還發現腫瘤類器官中含有與腎透明細胞癌緊密相關的突變。
 
所以說明,類器官模型與原代患者組織具有非常高的基因組相關性,從而為獲得更安全的腎細胞癌治療藥物提供幫助。
 
參考文獻:
Grassi L, Alfonsi R, Francescangeli F, et al. Organoids as a new model for improving regenerative medicine and cancer personalized therapy in renal diseases. Cell Death Dis. 2019;10(3):201
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